ПРЕДИСЛОВИЕ | 5 |
ВВЕДЕНИЕ | 7 |
|
Глава 1 |
ПОЛИМОРФИЗМ ДНК И ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ИСТОРИИ И ПРОИСХОЖДЕНИЯ НАРОДОВ | 9 |
|
Глава 2 |
ГЕНОГЕОГРАФИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ ГЕНОФОНДА |
2.1. Картографирование отдельного признака | 20 |
2.2. Надёжность картографического прогноза | 22 |
2.3. Статистическая информация карты | 24 |
2.4. Статистическая трансформация карт и картографирование гетерозиготности | 30 |
2.4.1. Методы статистической трансформации карт | 30 |
2.4.2. Картографирование гетерозиготности | 31 |
2.5. Выявление закономерностей на карте отдельного гена | 32 |
2.5.1. Общий подход к вычленению фоновых поверхностей (трендов) | 33 |
2.5.2. Вычленение фоновой поверхности осреднением | 33 |
2.5.3. Вычленение фоновой поверхности аппроксимирующей функцией | 37 |
2.6. Корреляционный анализ в геногеографии | 39 |
2.7. Главные компоненты изменчивости | 40 |
2.7.1. Катографирование главных компонент | 41 |
2.7.2. Пространство главных компонент | 45 |
2.8. Картографирование генетических расстояний | 49 |
2.9. Организация данных для изучения генофонда | 52 |
|
Глава 3 |
ГЕОГРАФИЯ ОТДЕЛЬНЫХ ТИПОВ ПОЛИМОРФИЗМА ДНК В ВОСТОЧНО- ЕВРОПЕЙСКОМ РЕГИОНЕ |
3.1. Монолокусный полиморфизм ДНК | 55 |
3.1.1. Диаллельные маркеры ДНК | 55 |
3.1.1.1. Инсерционно-делеционный полиморфизм гена рецептора хемокинов CCR5 | 55 |
3.1.1.2. Инсерционно-делеционный полиморфизм гена ангиотензин-превращающего фермента | 59 |
3.1.1.3. Однонуклеотидный полиморфизм. Полиморфизм локусов MET и D7S23, сцепленный с геном муковисцидоза | 60 |
3.1.1.4. Однонуклеотидный полиморфизм гена D2 рецептора дофамина | 62 |
3.1.1.5. Однонуклеотидный полиморфизм гена фактора VIII свёртывания крови | 66 |
3.1.1.6. Однонуклеотидный полиморфизм гена фенилаланингидроксилазы (локус MspI) | 66 |
3.1.2. Мультиаллельные маркеры ДНК | 68 |
3.1.2.1. Микросателлитный локус ДНК | 68 |
3.1.2.2. Полиморфизм микросателлитного локуса CAct685 | 84 |
3.1.2.3. Полиморфизм CA-повторов в интроне 13 гена фактора VIII свёртываемости крови | 90 |
3.1.2.4. Полиморфизм минисателлитного локуса ApoB | 91 |
3.1.2.5. Полиморфизм минисателлита D1S80 | 98 |
3.1.2.6. Полиморфизм минисателлитного локуса DXS52 | 101 |
3.1.2.7. Анализ полиморфизма минисателлитного локуса в гене фенилаланингидроксилазы | 104 |
3.1.2.8. Полиморфизм минисателлита гена переносчика серотонина | 105 |
3.2. Мультилокусные маркеры ДНК | 106 |
3.3. Полиморфизм ДНК Y-хромосомы | 121 |
3.3.1. Полиморфизм микросателлитных локусов в нерекомбинирующей области Y-хромосомы | 122 |
3.3.2. Анализ TC-транзиции локуса RBF5 и её ассоциации с микросателлитными маркерами | 126 |
3.4. Полиморфизм митохондриальной ДНК | 133 |
3.4.1. Рестрикционный полиморфизм AvaII и делеция 9 п.н. в V-области митохондриального генома в популяциях Волго-Уральского региона | 134 |
3.4.2. Рестрикционный полиморфизм главной некодирующей области мтДНК в популяциях Волго-Уральского региона | 139 |
3.4.3. Вариабельность контрольного региона мтДНК | 142 |
|
Глава 4 |
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНОФОНДА ВОСТОЧНОЙ ЕВРОПЫ | 156 |
|
Глава 5 |
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ АУТОСОМНЫХ, МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ И Y-ХРОМОСОМНЫХ МАРКЕРОВ ДНК | 170 |
|
ЗАКЛЮЧЕНИЕ | 181 |
|
ЛИТЕРАТУРА | 183 |
|
ПРИЛОЖЕНИЕ | 203 |