КнигоПровод.Ru22.11.2024

/Наука и Техника/Биология

Биотехнология: Кинетические основы микробиологических процессов: Учебное пособие для биологических и химических специальностей вузов — Варфоломеев С. Д., Калюжный С. В.
Биотехнология: Кинетические основы микробиологических процессов: Учебное пособие для биологических и химических специальностей вузов
Учебное издание
Варфоломеев С. Д., Калюжный С. В.
год издания — 1990, кол-во страниц — 296, ISBN — 5-06-000645-X, тираж — 11000, язык — русский, тип обложки — твёрд. 7Б, масса книги — 330 гр., издательство — Высшая школа
цена: 700.00 рубПоложить эту книгу в корзину
Сохранность книги — хорошая

Р е ц е н з е н т ы:
каф. микробиологии (зав. каф. — проф. Ленцнер) и лаборатория биоорганической химии (зав. лаб. — доц. Я. Ярв) Тартуского ГУ
акад. АН ЧСФР, проф. К. Мартинек

Формат 60x88 1/16. Бумага офсетная №2. Печать офсетная
ключевые слова — биотех, микробиолог, клеточн, микроб, популяц, микроорганизм, биокинет, лизис, автокаталит, биосинтез, симбиотроф, фотосинтез

Изложены основы и методы анализа кинетики микробиологических процессов. Детально рассмотрены аналитические модели клеточного роста, кинетические закономерности роста микробных популяций в различных режимах, методы определения кинетических параметров процессов. Дан количественный анализ факторов, осложняющих рост микроорганизмов, и проиллюстрированы возможности применения компьютерного анализа для исследования закономерностей микробной кинетики.


…В настоящее время количественная микробиология, основанная на химико-кинетическом моделировании процессов микробного роста, является активно развивающейся областью биокинетики, имеющей много интересных фундаментальных и практических приложений.

Изучение кинетических основ микробиологических процессов широко представлено в учебных планах химико-биологических факультетов университетов и ряда технологических вузов. Однако до настоящего времени в учебной литературе отсутствует сколько-нибудь полное и последовательное изложение количественных основ роста и развития микробных популяций. Данное учебное пособие призвано восполнить этот пробел. Основой для написания этой книги послужили исследования, проводимые в Московском университете, а также курсы лекций, читаемых на химическом и биологическом факультетах.

Курс рассчитан на читателей, владеющих основами дифференциального и интегрального исчислений в объёме общих курсов математического анализа вузов. Основная задача книги-изложение кинетических закономерностей, наблюдаемых при росте микробных популяций, с целью дать экспериментатору достаточно простые и надёжные методы, позволяющие выявить наиболее характерные особенности исследуемого процесса (например, истощение субстрата, ингибирование роста культур избытком субстрата или продуктом, лизис и др.).

В первую очередь внимание было обращено на анализ кинетических закономерностей автокаталитического роста микробных популяций в закрытых системах при периодическом культивировании. Дано кинетическое обоснование зависимости роста микроорганизмов от концентрации лимитирующего субстрата, рассмотрен ряд механистических моделей, позволяющих получить уравнение роста популяции на основе использования современных представлений о механизмах конверсии генетической информации при биосинтезе белка и нуклеиновых кислот (синтез ключевых метаболитов, репликация, транскрипция, трансляция). Сделан анализ абсолютных скоростей роста популяции с выявлением предельных и наиболее типичных, «средних», скоростей роста микроорганизмов. Была предпринята попытка связать изучаемые кинетические параметры с конкретными молекулярно-биологическими процессами, протекающими в живой микробной клетке.

Значительное внимание в книге уделено анализу интегральных кинетических кривых роста микробных популяций с учётом различных осложняющих факторов. Рассмотрены проблемы кинетической дискриминации механизмов ингибирования, обсуждены механизмы процессов, приводящих к появлению на кинетической кривой роста периодов индукции.

Изложена кинетическая теория роста популяций микроорганизмов при непрерывном культивировании в проточных системах. Как и для периодического культивирования, основное внимание обращено на кинетическое описание процессов с осложняющими факторами.

Использование методов кинетического моделирования с помощью ЭВМ позволяет на качественно новом уровне решать ряд вопросов кинетической микробиологии. В данной книге обсуждаются принципы кинетического моделирования роста микроорганизмов, на основе использования методов численного интегрирования дан ряд качественных подходов, позволяющих идентифицировать особенности роста популяции; рассмотрены кинетические модели роста с учётом лизиса клеток, проблемы моделирования развития смешанных и симбиотрофных культур; анализируются закономерности роста фотосинтезирующих микробных популяций.

Методы анализа по мере возможности иллюстрируются литературными данными или данными, полученными авторами книги.

Весьма полезным представляется наличие в учебном пособии задач, что поможет читателю лучше понять теоретические и практические аспекты кинетики роста микробных популяций…

ПРЕДИСЛОВИЕ
Авторы

ОГЛАВЛЕНИЕ

Предисловие3
Введение5
 
Г Л А В А  1
КИНЕТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ РОСТА КУЛЬТУР МИКРООРГАНИЗМОВ7
 
1.1. Зависимость скорости роста культур микроорганизмов от
концентрации лимитирующего субстрата. «Макроскопический» подход9
1.1.1. Простейшая схема взаимодействия клетки с субстратом9
1.1.2. Схема с равновесным «насыщением» клеток микроорганизма
    субстратом11
1.1.3. Схема с необратимой трансформацией субстрата в клетке13
1.1.4. Упрощённые методы анализа кинетики и механизмов
    автокаталитического роста микроорганизмов. Метод малого
    параметра19
1.1.5. Репликация, транскрипция, трансляция в кинетике роста
    микробной культуры25
1.2. Зависимость скорости роста культур микроорганизмов от
концентрации лимитирующего субстрата. «Микроскопический» подход31
1.2.1. Простейшая схема31
1.2.2. Многостадийность трансформации субстрата34
1.2.3. Многостадийность клеточного развития35
1.2.4. Влияние процессов переноса на кинетику роста популяции37
1.2.5. Старение клетки в процессе роста39
1.2.6. Кинетика роста микробной клетки с ускорением43
    ДНК-зависимая стадия конверсии лимитирующего субстрата44
    ДНК-зависимый репликационный процесс44
    ДНК-зависимые как ферментативная, так и репликационная стадии46
1.3. Пределы скорости роста культур микроорганизмов48
 
Г Л А В А  2
ЭКСПОНЕНЦИАЛЬНАЯ ФАЗА РОСТА КУЛЬТУР МИКРООРГАНИЗМОВ52
 
2.1. Определение параметров роста культуры52
2.2. Многосубстрактные микробные процессы56
2.3. Простейшие кинетические схемы57
2.4. Обобщённая модель многосубстрактного микробного процесса61
2.5. Многосубстрактность в кинетике роста M. thermoautotrophicum64
2.6. Ингибирование и активация роста микроорганизмов66
2.6.1. Общая схема действия обратимых эффекторов на кинетику
    роста микроорганизмов68
2.7. Влияние pH на кинетику роста микроорганизмов71
 
Г Л А В А  3
ИНТЕГРАЛЬНАЯ ФОРМА УРАВНЕНИЯ РОСТА МИКРОБНОЙ ПОПУЛЯЦИИ78
 
3.1. Замедление скорости роста культуры микроорганизмов при большой
плотности популяции78
3.2. Интегральная форма уравнения роста культуры микроорганизмов81
1. Рост в условиях первого порядка по субстрату84
2. Рост в условиях нулевого порядка по субстрату85
3.3. Приближённый метод анализа интегральной кинетической кривой
роста популяции микроорганизмов при больших глубинах конверсии
субстрата87
3.4. Примеры анализа экспериментальных кривых роста популяции91
3.5. Разностный метод анализа полных кинетических кривых роста
микроорганизмов94
3.6. Кинетические механизмы ограничения клеточного роста97
3.6.1. Кинетические модели роста микробной культуры с появлением
    субпопуляции, потерявшей способность к размножению98
    Прогрессирующая некомпетентность99
    Запрограммированный отказ101
3.6.2. Сравнение и дискриминация кинетических моделей
    ограничения клеточного роста103
 
Г Л А В А  4
ИНГИБИРОВАНИЕ РОСТА ПОПУЛЯЦИИ МИКРООРГАНИЗМОВ ИЗБЫТКОМ
СУБСТРАТА107
 
4.1. Кинетические модели роста с ингибированием субстратом107
4.1.1. Простейшая кинетическая схема107
4.1.2. Двухстадийная кинетическая схема109
4.1.3. Трёхстадийные кинетические схемы110
4.2. Определение параметров роста популяции микроорганизмов в
экспоненциальной фазе при ингибировании процесса высокими
концентрациями субстрата115
4.3. Анализ полной кинетической кривой роста117
 
Г Л А В А  5
ИНГИБИРОВАНИЕ РОСТА ПОПУЛЯЦИИ МИКРООРГАНИЗМОВ
ПРОДУКТАМИ ФЕРМЕНТАЦИИ122
 
5.1. Кинетические модели ингибирования продуктом122
5.1.1. Ингибирование продуктом на стадии взаимодействия
    субстрата с клеткой122
5.1.2. Ингибирование продуктом на стадии деления клетки127
5.1.3. Одновременное ингибирование продуктом обеих стадий128
5.1.4. Трёхстадийная схема130
5.1.5. Многостадийная схема134
5.2. Анализ полных кинетических кривых роста136
5.2.1. Конкурентное ингибирование продуктом реакции136
5.2.2. Неконкурентное ингибирование продуктом138
5.3. Определение механизма ингибирования из вида кинетической кривой
роста популяции микроорганизмов140
 
Г Л А В А  6
ПЕРИОДЫ ИНДУКЦИИ НА КИНЕТИЧЕСКИХ КРИВЫХ
РОСТА МИКРООРГАНИЗМОВ147
 
6.1. Трансформация пресубстрата в субстрат148
6.2. Адаптационный процесс150
6.3. Расходуемый ингибитор роста153
6.4. Дискриминация механизмов и определение кинетических параметров154
 
Г Л А В А  7
КУЛЬТИВИРОВАНИЕ МИКРООРГАНИЗМОВ В РЕЖИМЕ
ХЕМОСТАТА160
 
7.1. Неосложнённый рост160
7.1.1. Определение параметров роста культуры из данных по
    стационарным состояниям компонентов процесса164
    Изучение зависимости стационарной концентрации субстрата
       от скорости разбавления164
    Изучение зависимости стационарной концентрации биомассы от
       скорости разбавления и вводимой концентрации субстрата165
7.2. Ингибирование субстратом167
7.2.1. Стационарные уровни концентрации субстрата168
7.2.2. Стационарные уровни концентрации биомассы и продукта
    ферментации171
7.3. Ингибирование продуктом174
7.3.1. Конкурентное ингибирование продуктом175
    Стационарная концентрация субстрата179
    Стационарный уровень биомассы180
7.3.2. Неконкурентное ингибирование продуктом182
7.3.3. Ингибирование ионами водорода185
 
Г Л А В А  8
ИССЛЕДОВАНИЕ КИНЕТИКИ РОСТА МИКРОБНЫХ
ПОПУЛЯЦИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭВМ191
 
8.1. Численное интегрирование уравнения скорости роста микробной
популяции192
8.1.1. Уравнение скорости роста в безразмерных переменных194
8.1.2. Метод двойного зеркального отражения196
    Ингибирование субстратом197
    Ингибирование продуктом198
8.2. Рост культуры при наличии процесса лизиса клеток199
8.3. Кинетические закономерности репликации плазмид в растущей
популяции E. coli201
8.3.1. Кинетическая модель роста микробной популяции203
8.3.2. Кинетические закономерности роста числа плазмид204
8.3.3. Кинетическая модель репликационных процессов в системе
    с плазмидой207
8.4. Культивирование фототрофных микроорганизмов210
8.4.1. Зависимость скорости фотосинтеза от интенсивности света в
    плотностатном режиме210
8.4.2. Периодическое культивирование фотосинтезирующих
    микроорганизмов221
8.4.3. Фотосинтезирующая культура в режиме хемостата226
8.5. Симбиотические ассоциации микроорганизмов229
8.5.1. Ассоциация двух микроорганизмов230
8.5.2. Ассоциация трёх микроорганизмов233
8.5.3. Симбиотическая метагенерирующая ассоциация236
 
Г Л А В А  9
ОБРАБОТКА РЕЗУЛЬТАТОВ ИЗМЕРЕНИЙ В МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИХ
ИССЛЕДОВАНИЯХ249
 
9.1. Типы погрешностей измерений249
9.2. Связь систематической и случайной погрешностей250
9.3. Случайные погрешности. Нормальный закон распределений251
9.4. Генеральная и выборочная совокупности. Расчёт среднего и
дисперсии по выборочным данным255
9.5. Закон сложения случайных погрешностей256
9.6. Оценка параметров генеральной совокупности на основании
выборочных данных. Методы интервального оценивания258
9.7. Необходимое число измерений263
9.8. Обнаружение промахов264
9.9. Оценка точности результатов косвенных измерений266
9.10. Оценка параметров линейной зависимости методами регрессионного
анализа268
 
Заключение271
Задачи273
Ответы и решения284
Литература291
Предметный указатель293

Книги на ту же тему

  1. Саморегулируемые волны химических реакций и биологических популяций, Жижин Г. В., 2004
  2. Математическая биофизика, Романовский Ю. М., Степанова Н. В., Чернавский Д. С., 1984
  3. Химическая и биологическая кинетика: избранные труды: в 2 томах (комплект из 2 книг), Эмануэль Н. М., 2006
  4. Термодинамика и кинетика биологических процессов: Проблемы неравновесной термодинамики, кинетики переходных процессов, экстремальные принципы, переходные процессы в живых системах, Зотин А. И., ред., 1980
  5. Популяционная динамика лесных насекомых, Исаев А. С., Хлебопрос Р. Г., Недорезов Л. В., Кондаков Ю. П., Киселев В. В., Суховольский В. Г., 2001
  6. Жизнеспособность популяций: Природоохранные аспекты, Сулей М., ред, 1989
  7. Молекулярная и клеточная биофизика, Франк Г. М., ред., 1977
  8. Биотехнология: что это такое?, Вакула В. Л., 1989
  9. Теоретические основы биотехнологии древесных композитов: В двух кн. Кн. II: Ферменты, модели, процессы, Болобова А. В., Аскадский А. А., Кондращенко В. И., Рабинович М. Л., 2002
  10. Ферментативные процессы в биотехнологии, Безбородов А. М., Загустина Н. А., Попов В. О., 2008
  11. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение, Глик Б., Пастернак Д., 2002
  12. Микроорганизмы в биогеотехнологиях переработки сульфидных руд, Кондратьева Т. Ф., Булаев А. Г., Муравьев М. И., 2015
  13. Энергетика ассимилирующей клетки и фотосинтез, Петров В. Е., 1975
  14. Лекции по природоведческой микробиологии, Заварзин Г. А., 2004
  15. Микробиология (с вирусологией и иммунологией). — 4-е изд., перераб. и доп., Пяткин К. Д., Кривошеин Ю. С., 1980
  16. Микробиологические методы определения витаминов, Одинцова Е. Н., 1959
  17. Бактерии Pseudomonas и Azotobacter как объекты сельскохозяйственной биотехнологии, Логинов О. Н., 2005
  18. Микробиологический контроль активного ила биореакторов очистки сточных вод от биогенных элементов, Козлов М. Н., Дорофеев А. Г., Асеева В. Г., 2012
  19. Молекулярные основы взаимоотношений ассоциативных микроорганизмов с растениями, 2005
  20. Охотники за микробами, де Крюи П., 2001
  21. Растительная клеточная стенка как динамичная система, Горшкова Т. А., 2007

© 1913—2013 КнигоПровод.Ruhttp://knigoprovod.ru